机甲兽神第一部人类和机械生命体决战后过了1000年，地球逐渐从颓废中恢复了过来，但是兵强马壮的巴西帝国又发动了征服世界的战争。　　少女伊可儿偶然遇到了1000年前大战中幸存的机动兵器“夏安”，一人一机开始了冒险之旅……