晶码战士本剧讲述了哥哥洸人与泛自闭症的弟弟美路人相依为命。配合着只要在固定作息中就能无碍生活的美路人，洸人风平浪静地过着稳定无事的日子。有一天，在两人的身边，突然出现了一个自称“狮子”的小男孩，而他们不得不收留了他，故事由此开始。虽然还不习惯，但在与“狮子”三人一起生活的过程中，兄弟俩明白了他被寄养的背景和“某个事件”有关，从此平静的日子开始被暴风雨般的漩涡吞没。